ZAT隊接到有怪獸的消息，立刻趕往了現場，怪獸來自何處，為何而來大家都不得而知。為了查明怪獸從何而來，光太郎冒險取到了怪獸身體的一部分。北島將從怪獸身上取下的標本送至本部，查明了怪獸是從美杜莎星來的，那里的電磁波極為混亂，可能發生了爭斗。留在現場的光太郎等人發現了一名少女，少女請求他們消滅怪獸黑爾茨，因為她的爺爺被黑爾茨殺害了。